Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Scarf2P59222 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scarf2P59222 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms