Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn4P57780 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn4P57780 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn4P57780 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn4P57780 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn4P57780 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn4P57780 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn4P57780 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actn4P57780 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn4P57780 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms