Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms