Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TdgP56581 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TdgP56581 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TdgP56581 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TdgP56581 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TdgP56581 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TdgP56581 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TdgP56581 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TdgP56581 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TdgP56581 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TdgP56581 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TdgP56581 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TdgP56581 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TdgP56581 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TdgP56581 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TdgP56581 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TdgP56581 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TdgP56581 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TdgP56581 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TdgP56581 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TdgP56581 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TdgP56581 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TdgP56581 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TdgP56581 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TdgP56581 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TdgP56581 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TdgP56581 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TdgP56581 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TdgP56581 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TdgP56581 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TdgP56581 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TdgP56581 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TdgP56581 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TdgP56581 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TdgP56581 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TdgP56581 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TdgP56581 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TdgP56581 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TdgP56581 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TdgP56581 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TdgP56581 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TdgP56581 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TdgP56581 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TdgP56581 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TdgP56581 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TdgP56581 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TdgP56581 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TdgP56581 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TdgP56581 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TdgP56581 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TdgP56581 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TdgP56581 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TdgP56581 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TdgP56581 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TdgP56581 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TdgP56581 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TdgP56581 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TdgP56581 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TdgP56581 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TdgP56581 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TdgP56581 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TdgP56581 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TdgP56581 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TdgP56581 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TdgP56581 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TdgP56581 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TdgP56581 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TdgP56581 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TdgP56581 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TdgP56581 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TdgP56581 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TdgP56581 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TdgP56581 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TdgP56581 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TdgP56581 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TdgP56581 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TdgP56581 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TdgP56581 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TdgP56581 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TdgP56581 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TdgP56581 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TdgP56581 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TdgP56581 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TdgP56581 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TdgP56581 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TdgP56581 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TdgP56581 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TdgP56581 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TdgP56581 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TdgP56581 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TdgP56581 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TdgP56581 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TdgP56581 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TdgP56581 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TdgP56581 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TdgP56581 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TdgP56581 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TdgP56581 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TdgP56581 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TdgP56581 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms