Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ctbp2P56546 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctbp2P56546 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms