Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mc4rP56450 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mc4rP56450 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Mc4rP56450 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Mc4rP56450 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mc4rP56450 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mc4rP56450 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mc4rP56450 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mc4rP56450 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mc4rP56450 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mc4rP56450 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms