Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp5eP56382 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atp5eP56382 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.6 ms