Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1P55194 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms