Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e1P52482 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms