Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pa2g4P50580 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pa2g4P50580 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pa2g4P50580 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pa2g4P50580 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pa2g4P50580 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pa2g4P50580 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pa2g4P50580 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pa2g4P50580 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pa2g4P50580 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pa2g4P50580 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pa2g4P50580 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pa2g4P50580 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pa2g4P50580 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pa2g4P50580 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pa2g4P50580 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pa2g4P50580 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms