Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpdP50404 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpdP50404 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SftpdP50404 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SftpdP50404 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpdP50404 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SftpdP50404 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SftpdP50404 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpdP50404 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpdP50404 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SftpdP50404 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms