Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VegfbP49766 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VegfbP49766 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VegfbP49766 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VegfbP49766 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VegfbP49766 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VegfbP49766 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VegfbP49766 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VegfbP49766 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VegfbP49766 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VegfbP49766 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VegfbP49766 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VegfbP49766 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VegfbP49766 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VegfbP49766 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VegfbP49766 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VegfbP49766 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VegfbP49766 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms