Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb42P49222 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb42P49222 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb42P49222 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb42P49222 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epb42P49222 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb42P49222 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb42P49222 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epb42P49222 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb42P49222 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb42P49222 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epb42P49222 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Epb42P49222 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epb42P49222 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epb42P49222 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epb42P49222 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epb42P49222 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epb42P49222 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epb42P49222 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epb42P49222 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms