Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CitP49025 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CitP49025 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CitP49025 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CitP49025 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CitP49025 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CitP49025 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CitP49025 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CitP49025 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CitP49025 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CitP49025 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CitP49025 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CitP49025 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CitP49025 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CitP49025 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CitP49025 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CitP49025 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CitP49025 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CitP49025 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CitP49025 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CitP49025 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CitP49025 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CitP49025 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CitP49025 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CitP49025 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CitP49025 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CitP49025 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CitP49025 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CitP49025 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CitP49025 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CitP49025 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CitP49025 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CitP49025 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CitP49025 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CitP49025 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CitP49025 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CitP49025 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CitP49025 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CitP49025 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CitP49025 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CitP49025 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CitP49025 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CitP49025 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CitP49025 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CitP49025 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CitP49025 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CitP49025 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CitP49025 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CitP49025 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CitP49025 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CitP49025 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CitP49025 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CitP49025 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CitP49025 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CitP49025 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CitP49025 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CitP49025 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CitP49025 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CitP49025 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CitP49025 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CitP49025 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CitP49025 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CitP49025 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CitP49025 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CitP49025 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CitP49025 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CitP49025 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CitP49025 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CitP49025 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CitP49025 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CitP49025 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CitP49025 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CitP49025 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CitP49025 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CitP49025 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CitP49025 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CitP49025 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CitP49025 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CitP49025 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CitP49025 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CitP49025 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CitP49025 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CitP49025 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CitP49025 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CitP49025 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CitP49025 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CitP49025 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CitP49025 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CitP49025 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CitP49025 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CitP49025 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CitP49025 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CitP49025 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CitP49025 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CitP49025 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CitP49025 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CitP49025 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CitP49025 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CitP49025 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CitP49025 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms