Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prox1P48437 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prox1P48437 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prox1P48437 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Prox1P48437 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prox1P48437 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prox1P48437 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prox1P48437 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prox1P48437 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prox1P48437 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prox1P48437 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms