Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Edn3P48299 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Edn3P48299 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Edn3P48299 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edn3P48299 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edn3P48299 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn3P48299 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edn3P48299 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edn3P48299 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edn3P48299 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edn3P48299 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms