Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VdrP48281 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VdrP48281 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VdrP48281 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VdrP48281 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VdrP48281 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VdrP48281 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VdrP48281 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VdrP48281 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VdrP48281 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VdrP48281 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VdrP48281 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VdrP48281 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VdrP48281 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VdrP48281 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VdrP48281 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VdrP48281 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VdrP48281 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VdrP48281 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VdrP48281 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VdrP48281 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VdrP48281 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VdrP48281 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VdrP48281 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VdrP48281 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VdrP48281 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VdrP48281 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VdrP48281 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VdrP48281 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VdrP48281 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VdrP48281 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VdrP48281 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VdrP48281 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VdrP48281 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VdrP48281 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VdrP48281 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VdrP48281 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VdrP48281 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VdrP48281 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VdrP48281 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VdrP48281 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VdrP48281 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VdrP48281 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VdrP48281 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VdrP48281 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VdrP48281 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VdrP48281 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
VdrP48281 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VdrP48281 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VdrP48281 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VdrP48281 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VdrP48281 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VdrP48281 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VdrP48281 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VdrP48281 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VdrP48281 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VdrP48281 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VdrP48281 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VdrP48281 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VdrP48281 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VdrP48281 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VdrP48281 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VdrP48281 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VdrP48281 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VdrP48281 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VdrP48281 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VdrP48281 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VdrP48281 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VdrP48281 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VdrP48281 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VdrP48281 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VdrP48281 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VdrP48281 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VdrP48281 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VdrP48281 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VdrP48281 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VdrP48281 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VdrP48281 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VdrP48281 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VdrP48281 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VdrP48281 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VdrP48281 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VdrP48281 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VdrP48281 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VdrP48281 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VdrP48281 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VdrP48281 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VdrP48281 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VdrP48281 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VdrP48281 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VdrP48281 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VdrP48281 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VdrP48281 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VdrP48281 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VdrP48281 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VdrP48281 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VdrP48281 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VdrP48281 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VdrP48281 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VdrP48281 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms