Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TesP47226 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TesP47226 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TesP47226 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TesP47226 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TesP47226 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TesP47226 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TesP47226 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TesP47226 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TesP47226 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TesP47226 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TesP47226 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TesP47226 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TesP47226 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TesP47226 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TesP47226 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TesP47226 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TesP47226 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TesP47226 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TesP47226 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TesP47226 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TesP47226 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TesP47226 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TesP47226 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TesP47226 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TesP47226 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TesP47226 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TesP47226 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TesP47226 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TesP47226 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TesP47226 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TesP47226 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TesP47226 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TesP47226 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TesP47226 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TesP47226 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TesP47226 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TesP47226 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TesP47226 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TesP47226 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TesP47226 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TesP47226 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TesP47226 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TesP47226 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TesP47226 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TesP47226 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TesP47226 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TesP47226 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TesP47226 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TesP47226 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TesP47226 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TesP47226 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TesP47226 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TesP47226 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TesP47226 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TesP47226 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TesP47226 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TesP47226 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TesP47226 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TesP47226 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TesP47226 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TesP47226 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TesP47226 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TesP47226 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TesP47226 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TesP47226 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TesP47226 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TesP47226 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TesP47226 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TesP47226 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TesP47226 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TesP47226 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TesP47226 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TesP47226 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TesP47226 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TesP47226 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TesP47226 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TesP47226 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TesP47226 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TesP47226 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TesP47226 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TesP47226 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TesP47226 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TesP47226 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TesP47226 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TesP47226 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TesP47226 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TesP47226 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TesP47226 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TesP47226 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TesP47226 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TesP47226 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TesP47226 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TesP47226 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TesP47226 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TesP47226 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TesP47226 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TesP47226 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TesP47226 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TesP47226 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms