Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tac1P41539 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tac1P41539 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tac1P41539 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tac1P41539 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tac1P41539 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tac1P41539 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tac1P41539 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tac1P41539 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tac1P41539 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms