Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik2P39087 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik2P39087 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik2P39087 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik2P39087 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grik2P39087 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik2P39087 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik2P39087 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik2P39087 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grik2P39087 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grik2P39087 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik2P39087 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik2P39087 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik2P39087 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms