Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PtprkP35822 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PtprkP35822 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PtprkP35822 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprkP35822 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprkP35822 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprkP35822 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PtprkP35822 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprkP35822 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprkP35822 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PtprkP35822 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprkP35822 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PtprkP35822 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PtprkP35822 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtprkP35822 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms