Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp4P35123 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp4P35123 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp4P35123 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp4P35123 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp4P35123 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp4P35123 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp4P35123 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp4P35123 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp4P35123 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp4P35123 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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