Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Apoc1P34928 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoc1P34928 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms