Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Tfap2aP34056 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms