Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms