Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd1P33215 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nedd1P33215 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms