Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc5P32043 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms