Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa2P31245 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms