Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VtnP29788 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VtnP29788 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VtnP29788 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VtnP29788 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VtnP29788 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VtnP29788 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VtnP29788 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VtnP29788 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VtnP29788 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VtnP29788 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VtnP29788 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VtnP29788 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VtnP29788 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VtnP29788 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VtnP29788 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VtnP29788 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VtnP29788 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VtnP29788 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VtnP29788 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VtnP29788 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VtnP29788 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VtnP29788 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VtnP29788 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VtnP29788 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VtnP29788 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VtnP29788 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VtnP29788 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VtnP29788 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VtnP29788 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VtnP29788 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VtnP29788 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VtnP29788 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VtnP29788 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VtnP29788 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VtnP29788 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VtnP29788 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VtnP29788 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VtnP29788 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VtnP29788 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VtnP29788 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VtnP29788 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VtnP29788 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VtnP29788 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VtnP29788 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VtnP29788 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VtnP29788 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VtnP29788 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VtnP29788 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VtnP29788 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VtnP29788 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VtnP29788 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VtnP29788 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VtnP29788 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VtnP29788 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VtnP29788 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VtnP29788 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VtnP29788 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VtnP29788 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VtnP29788 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VtnP29788 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VtnP29788 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VtnP29788 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VtnP29788 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VtnP29788 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VtnP29788 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VtnP29788 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VtnP29788 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VtnP29788 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VtnP29788 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VtnP29788 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VtnP29788 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VtnP29788 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VtnP29788 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VtnP29788 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VtnP29788 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VtnP29788 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VtnP29788 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VtnP29788 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VtnP29788 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VtnP29788 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VtnP29788 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VtnP29788 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VtnP29788 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VtnP29788 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VtnP29788 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VtnP29788 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VtnP29788 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VtnP29788 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VtnP29788 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VtnP29788 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VtnP29788 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VtnP29788 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VtnP29788 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VtnP29788 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VtnP29788 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VtnP29788 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VtnP29788 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VtnP29788 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VtnP29788 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms