Protein–RNA interactions for Protein: P29319

Epha3, Ephrin type-A receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha3P29319 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha3P29319 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha3P29319 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha3P29319 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha3P29319 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha3P29319 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha3P29319 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha3P29319 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha3P29319 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha3P29319 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha3P29319 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha3P29319 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha3P29319 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha3P29319 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha3P29319 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha3P29319 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha3P29319 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha3P29319 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha3P29319 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha3P29319 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha3P29319 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha3P29319 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Epha3P29319 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha3P29319 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha3P29319 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha3P29319 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms