Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja8P28236 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja8P28236 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja8P28236 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja8P28236 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja8P28236 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja8P28236 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja8P28236 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja8P28236 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja8P28236 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja8P28236 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja8P28236 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja8P28236 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms