Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-DMaP28078 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms