Protein–RNA interactions for Protein: P28063

Psmb8, Proteasome subunit beta type-8, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb8P28063 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb8P28063 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb8P28063 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb8P28063 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb8P28063 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb8P28063 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb8P28063 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb8P28063 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb8P28063 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb8P28063 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms