Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CenpbP27790 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CenpbP27790 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CenpbP27790 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CenpbP27790 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CenpbP27790 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CenpbP27790 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CenpbP27790 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CenpbP27790 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
CenpbP27790 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CenpbP27790 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CenpbP27790 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CenpbP27790 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CenpbP27790 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CenpbP27790 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CenpbP27790 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CenpbP27790 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CenpbP27790 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CenpbP27790 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms