Protein–RNA interactions for Protein: P27784

Ccl6, C-C motif chemokine 6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl6P27784 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl6P27784 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl6P27784 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms