Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc5P27641 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Xrcc5P27641 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms