Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af2P26369 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af2P26369 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af2P26369 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af2P26369 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af2P26369 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af2P26369 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af2P26369 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af2P26369 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af2P26369 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms