Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
CftrP26361 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CftrP26361 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CftrP26361 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CftrP26361 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CftrP26361 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CftrP26361 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CftrP26361 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CftrP26361 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CftrP26361 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CftrP26361 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CftrP26361 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CftrP26361 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CftrP26361 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CftrP26361 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CftrP26361 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CftrP26361 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CftrP26361 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CftrP26361 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CftrP26361 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CftrP26361 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CftrP26361 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CftrP26361 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CftrP26361 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CftrP26361 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CftrP26361 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CftrP26361 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CftrP26361 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CftrP26361 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CftrP26361 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CftrP26361 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
CftrP26361 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CftrP26361 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CftrP26361 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CftrP26361 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CftrP26361 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CftrP26361 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CftrP26361 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CftrP26361 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CftrP26361 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CftrP26361 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CftrP26361 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CftrP26361 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CftrP26361 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CftrP26361 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CftrP26361 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CftrP26361 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CftrP26361 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CftrP26361 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CftrP26361 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CftrP26361 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CftrP26361 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CftrP26361 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CftrP26361 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CftrP26361 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CftrP26361 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CftrP26361 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CftrP26361 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CftrP26361 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CftrP26361 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CftrP26361 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CftrP26361 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CftrP26361 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CftrP26361 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CftrP26361 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CftrP26361 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CftrP26361 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CftrP26361 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CftrP26361 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CftrP26361 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CftrP26361 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CftrP26361 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CftrP26361 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CftrP26361 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CftrP26361 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CftrP26361 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CftrP26361 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CftrP26361 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CftrP26361 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CftrP26361 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CftrP26361 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CftrP26361 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CftrP26361 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CftrP26361 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
CftrP26361 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CftrP26361 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CftrP26361 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CftrP26361 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CftrP26361 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CftrP26361 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CftrP26361 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CftrP26361 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CftrP26361 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CftrP26361 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CftrP26361 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CftrP26361 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CftrP26361 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CftrP26361 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CftrP26361 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CftrP26361 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms