Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itgb7P26011 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb7P26011 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms