Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf1bP25119 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf1bP25119 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf1bP25119 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf1bP25119 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf1bP25119 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf1bP25119 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf1bP25119 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf1bP25119 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms