Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd12P23812 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd12P23812 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms