Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZfaP23607 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZfaP23607 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZfaP23607 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZfaP23607 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZfaP23607 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZfaP23607 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZfaP23607 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZfaP23607 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZfaP23607 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZfaP23607 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZfaP23607 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZfaP23607 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZfaP23607 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZfaP23607 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZfaP23607 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZfaP23607 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZfaP23607 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZfaP23607 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZfaP23607 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZfaP23607 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZfaP23607 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZfaP23607 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZfaP23607 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZfaP23607 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZfaP23607 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZfaP23607 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZfaP23607 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZfaP23607 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZfaP23607 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZfaP23607 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZfaP23607 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZfaP23607 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZfaP23607 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZfaP23607 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZfaP23607 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZfaP23607 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZfaP23607 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZfaP23607 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZfaP23607 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZfaP23607 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZfaP23607 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZfaP23607 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZfaP23607 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZfaP23607 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZfaP23607 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZfaP23607 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZfaP23607 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZfaP23607 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZfaP23607 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZfaP23607 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZfaP23607 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZfaP23607 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZfaP23607 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZfaP23607 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms