Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrcc6P23475 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrcc6P23475 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms