Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pde6bP23440 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6bP23440 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms