Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnc2P20801 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms