Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ntf3P20181 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms