Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a1P19437 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a1P19437 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a1P19437 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ms4a1P19437 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms