Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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