Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn1s1P19228 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms