Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka1P18653 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka1P18653 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms